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- ハロアーキュラ属古細菌(Haloarcula japonica TR-1T (= NBRC 101032T))
- グルコンアセトバクター属酢酸菌(Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288)
- アンフィバチルス属細菌(Amphibacillus xylanus NBRC 15112T)
- メタノコッカス属古細菌(Methanococcus maripaludis KA1(=NBRC 102054)
及びOS7(=NBRC 105638)) - ルブリヴィヴァックス属細菌(Rubrivivax gelatinosus NBRC 100245(= IL144))
- セレノモナス属細菌(Selenomonas ruminantiumsubsp. lactilyticaTAM6421 (= NBRC 103574))
- サーモスルフィディバクター属細菌(Thermosulfidibacter takaii ABI70S6T(= NBRC 103674T))
- バークホルデリア属細菌(Burkholderia plantarii MAFF301723T(= NBRC 104884T))
- カルディリネア属細菌(Caldilinea aerophila STL-6-O1T (= NBRC 104270T))
- イルマトバクター属細菌(Ilumatobacter coccineus YM16-304 (=NBRC 103263))
- 黒麹菌(Aspergillus luchuensis NBRC 4314)
- プランクトミセス門細菌(Phycisphaera mikurensis FYK2301M01T(= NBRC 102666T))
- 高温アルコール発酵酵母(Kluyveromyces marxianus DMKU3-1042)
- ホモ火落ち乳酸菌(Lactobacillus homohiochii NBRC 13120)
- ミレニアムプロジェクト「完全長cDNA※1構造解析事業」
- 標準 SNPs 解析事業(頻度解析)
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