カルディリネア属細菌（Caldilinea aerophila STL-6-O1^T （= NBRC 104270^T））

１．研究テーマ

カルディリネア属細菌（Caldilinea aerophila STL-6-O1^T (= NBRC 104270^T)）のゲノム解析に係る共同研究

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２．研究目標

Caldilinea aerophila STL-6-O1^T (= NBRC 104270^T)のゲノム解析を行い、それをAnaerolinea thermophila UNI-1^T (= NBRC 100420^T)と比較することにより、本菌の多様なエネルギー獲得様式に係わる遺伝子群を解明する。

また、温泉バイオマット形成に関わる発現調節機構やコーラム・センシングのメカニズムをゲノム情報から考察する。

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３．共同研究先

独立行政法人産業技術総合研究所

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４．研究費用

ＮＩＴＥ及び共同研究先が分担する。

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５．研究期間

平成２０年７月から

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微生物の概要

Caldilinea aerophila STL-6-O1^T (= NBRC 104270^T)は、1999年に独立行政法人産業技術総合研究所の鎌形らによって、岐阜県の中尾温泉硫黄芝から分離された好熱性の通性嫌気性細菌で、55 ℃を至適生育温度とし、多細胞繊維状の形態を持っています。

本菌の属するChloroflexi門は、系統的にProteabacteria門に匹敵するほどの多様性を持っていることが、近年の研究の進展によって明らかになってきています。そのChloroflexi門でゲノム解析された例は未だに少なく、中でも亜門１（chloroflexi subphylum I）においてゲノム解析が進行しているものは、ＮＩＴＥにて解析中のAnaerolinea thermophila UNI-1^T (= NBRC 100420^T)だけです。

本菌株は、Chloroflexi亜門１のCaldilinea綱を代表する随一の分離株であり、このAnaerolinea thermophila UNI-1^T (= NBRC 100420^T)と並んで系統分類学上の重要な基準となる株です。

Anaerolinea thermophilaと本菌は、ともにChloroflexi亜門１に属し、繊維状の形態を持つ点で共通していますが、生理学的な性質が異なっており、Anaerolinea thermophilaが絶対嫌気性であるのに対し、本菌は好気条件下では酸素呼吸で生育することができます。

これら２菌の比較ゲノム解析を行うことによって、亜門１における酸素耐性など、重要な形質や遺伝学的性質の関連性を明らかにすることができます。

また、硫黄芝というバイオマットの形成に深く関わっている細菌でもあり、バイオマット形成に関わる発現調節機構やコーラム・センシングのメカニズムを遺伝学的見地から解明できると期待されます。

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